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至於他和嚴孟祿的金錢來往，郭明良表示，兩人是高中
同學，也是好朋友、好兄弟，自己的個人環境較困苦，在台大升等教授後買房，但因為高利息而壓力很大，經濟較寬裕的嚴孟祿得知後，主動無息貸款給他，也未要求何時前一定要還清，雙方也留下清楚的支票或匯款紀錄，但這些往返的票據紀錄，被有心人士侵入電腦，將資料散播到媒體，並用不當連結指稱兩人買賣論文。
郭明良表示，因為對查詩婷的說法有疑慮，他決定再次調查，但查詩婷支吾其詞，因此他不再相信，主動去信期刊撤回論文並呈報校方，而查詩婷也在十一月九日主動請辭，他在十一月十日將查詩婷的自白書呈交校方，當天媒體就報導此消息，由於他監督不周，所以在十一月十一日口頭向校方請辭，十一月十八日配合校方發聲明稿後就靜候調查。
對於論文風波，郭明良坦承，他督導有缺失，向台大請辭也是為了承擔督導不周的責任，但實驗室團隊共產生一一七篇論文，其中僅有兩篇論文因違反學術倫理被撤回，這是單一個案，並非外傳的實驗室集體造假，不應該污衊其他學生的努力，也拒絕此汙名扣在實驗室頭上。
郭明良在記者會一開始就二度鞠躬道歉，並表示對於論文事件造成社會資源浪費，對學術界造成很大衝擊，他向學術界和社會大眾道歉，但事
件發生後他並沒有神隱，一直都在積極處理和準備資料。
郭明良指出，團隊成員在十月二十日發現博士後研究
員查詩婷在二○一六年八月十五日發表的論文有瑕疵，他主動聯絡查詩婷，但查詩婷僅表示標示不清，他就主動去信該期刊堪誤，後來國外匿名網站在十一月二日
再度質疑該篇論文，他也再次詢問查詩婷，但查詩婷依然否認，因此他於十一月四日再次去函詢問論文處理進度。
被質疑論文造假的台大教授郭明良今天首度現身，為論文風波造成衝擊鞠躬道歉，他強調未參與造假，更非集體造假，也駁斥買賣論文，盼外界不要未審先判。
郭明良表示，兩人共同掛名的論文只有八篇，其中只有兩篇他是通訊作者，但嚴孟祿並
未用這兩
篇論文升等，怎會有對價關係，對於外界指控，他嚴厲駁斥。
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